铠武活跃的舞台是在一个新兴都市。以巨大企业为核心，经济十分繁荣，然而却有种闭塞的感觉，于是年轻人通过跳街舞驱散沉闷的气氛。在这些年轻人中间，暗地里流行着一种通过lockseed召唤小动物Invase，并让它们互相战斗的游戏。这些小动物Invase在游戏进行中会从打开的“异世界之门”现身，然而通往“异世界”的门却开始在世界各地开启，招来了威胁人类的危机。从异世界出现的怪物究竟是？它们的目的是？假面骑士铠武将如何拯救全人类的危机？他的对手骑士的命运会是？在混沌的现代社会，为贯彻信念而战，简直就是假面骑士的战国时代！用鲜艳的水果lockseed变身，厚重感满溢的骑士战斗要开始了!

这是一个靠足球决定胜负成败的世界，人声鼎沸的泽芽市运动场，一场精彩纷呈的赛事正在进行。葛叶紘汰（佐野岳饰）所率领的Team.铠武和驱纹戒斗（小林丰 饰）领衔的Team.巴隆激烈角逐，双方为了顶尖殊荣“全骑士杯”使出浑身解数，各逞其能。 匪夷所思的是，本应该死去的角居裕也（崎本大海 饰）出现在Team.铠武的阵容中，而Team.Charmant的凰莲（吉田メタル饰）、城乃内（松田凌 饰）、初濑亮二（白又敦 饰）甚至Team.创世纪的贵虎（久保田悠来 饰）、SID（波冈一喜 饰）、耀子（佃井皆美 饰）等人都在台下注视着这场比赛。这些队伍共同觊觎着同一个目标，那就是代表着无上荣耀的“黄金果实”。 比赛仍在进行，紘汰却倍感蹊跷。一向被海姆植物侵蚀的泽芽市为何突然一片祥和？裕也、初濑、SID等人为何仍在人世？接二连三出现在紘汰面前的少年拿比素（田中伟登 饰）其真正的身份又是谁？随着全骑士杯进入白热化，更为可怕的邪恶阴谋昭然若揭，假面骑士们面临前所未有的灭绝危机！！

专注各种大案要案的警视厅刑事部搜查一课，这一次迎来了一名非同寻常的新人藤堂比奈子（波瑠饰）。藤堂具有过目不忘的惊人记忆力，历年所发生过的各种恶性案件她都熟稔非常，甚至总能在关键时刻从脑中的资料库里提取有效信息协助破案。和她搭档的东海林泰久（横山裕饰）也同样是个不走寻常路的刑警，为了破案他不惜使用非法手段，而当年一段黑色经历让他变得愤世嫉俗。东海林发现，藤堂对杀人案——尤其是变态猎奇杀人案有着近乎病态的兴趣。朋友之死她无动于衷，为了查案甚至敢于和罪犯近距离接触。难不成她本身就享受身处犯罪中心的快乐？